Fondée en 1972, l’association regroupe l’ensemble des agents comptables d’université et établissements assimilés. L’association veut constituer un lien réel et concret entre tous ses membres. Elle est un lieu d’échanges, un moyen d’information, un « outil » à la disposition de tous. Ayant aussi pour but de « participer à l’élaboration et à l’application des règles comptables applicables à l’université », l’association est un interlocuteur naturel et reconnu des autorités de tutelle : Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, Direction générale des finances publiques (DGFIP). Elle est régulièrement auditionnée par les missions et participe à divers groupes de travail et d’étude.
Le correspondant de l'AACUE auprès de Fondafip est José Moralès